Arş. Gör. SİNEM YILMAZ

Arş. Gör. SİNEM YILMAZ

Arş. Gör.
SİNEM YILMAZ

User

1011

© Bilgi İşlem Daire Başkanlığı
Tüm Hakları Saklıdır.

Genel Bilgiler

Kurum Bilgileri

  • Kurum Bilgi RAFET KAYIŞ MÜHENDİSLİK FAKÜLTESİ, GENETİK VE BİYOMÜHENDİSLİK BÖLÜMÜ, GENETİK VE BİYOMÜHENDİSLİK ANABİLİM DALI
  • UnvanARAŞTIRMA GÖREVLİSİ

İletişim Bilgileri

  • Ofis GENETİK VE BİYOMÜHENDİSLİK BÖLÜMÜ
  • AdresRAFET KAYIŞ MÜHENDİSLİK FAKÜLTESİ, GENETİK VE BİYOMÜHENDİSLİK BÖLÜMÜ

Biyografi

Scopus Bilgiler

Scopus Citation-Count Scopus Cited-by-count Scopus Toplam Yayın Scopus Eid Değeri Scopus Orcid Değeri Scopus Link

Google Scholar Bilgiler

Google H-index Google i10-index Google H-index 2018 Google i10-index 2018 Google Atıf Google Atıf 2018

Araştırma Alanları

Biyoteknoloji

Moleküler Biyoloji

Eğitim Bilgileri

Eğitim Bilgileri

  • Doktora

    EGE ÜNİVERSİTESİ, FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ, BİYOTEKNOLOJİ (DR),

    2017

  • Lisans

    EGE ÜNİVERSİTESİ, MÜHENDİSLİK FAKÜLTESİ, BİYOMÜHENDİSLİK BÖLÜMÜ,BİYOMÜHENDİSLİK PR.

    2011 2007

  • Yüksek Lisans

    EGE ÜNİVERSİTESİ, FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ, BİYOMÜHENDİSLİK (YL) (TEZLİ),

    2015 2013

Yaptığı Tezler

  • BİYOTEKNOLOJİ (DR)

    ,
    2017

  • BİYOMÜHENDİSLİK BÖLÜMÜ

    , 2011
    2011 2007

  • BİYOMÜHENDİSLİK (YL) (TEZLİ)

    Veratrum album bitkisi sekonder metabolitlerinin ve sitotoksisitelerinin araştırılması

    ERDAL BEDİR , 2015
    2015 2013

Yabancı Diller

  • İngilizce : 2024, YÖKDİL, 87,50000

Deneyimler

Akademik Unvanlar

  • ARAŞTIRMA GÖREVLİSİ

    ALANYA ALAADDİN KEYKUBAT ÜNİVERSİTESİ, MÜHENDİSLİK FAKÜLTESİ, ALANYA ALAADDİN KEYKUBAT ÜNİVERSİTESİ/MÜHENDİSLİK FAKÜLTESİ/GENETİK VE BİYOMÜHENDİSLİK BÖLÜMÜ/GENETİK VE BİYOMÜHENDİSLİK PR. (İNGİLİZCE)/

    2023

  • ARAŞTIRMA GÖREVLİSİ

    EGE ÜNİVERSİTESİ, FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ, EGE ÜNİVERSİTESİ/FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ/

    2018

Yönetimsel Görevler

Verilen Dersler

Yayınlar & Eserler

MAKALELER

Design, synthesis, and biological evaluation of some novel naphthoquinone‐glycine/β‐alanine anilide derivatives as noncovalent proteasome inhibitors

TATAR İREM, UYSAL ŞİRİN, YILMAZ SİNEM, BALLAR KIRMIZIBAYRAK PETEK, SOYER ZEYNEP Wiley,cilt.101, ss.-, 2023 (SCI-Expanded dergi )

Potent telomerase activators from a novel sapogenin via biotransformation utilizing Camarosporium laburnicola, an endophytic fungus

KÜÇÜKSOLAK MELİS, YILMAZ SİNEM, BALLAR KIRMIZIBAYRAK PETEK, BEDİR ERDAL Springer Science and Business Media LLC,cilt.22, ss.-, 2023 (SCI-Expanded dergi )

Induction of Divergent Cell Death Pathways by Urea and Carbohydrazide Derivatives

YILMAZ SİNEM, TOK FATİH, Atalay Sahar Esra, KAYMAKÇIOĞLU BEDİA, BALLAR KIRMIZIBAYRAK PETEK Bentham Science Publishers Ltd.,cilt.22, ss.-, 2022 (SCI-Expanded dergi )

Novel regulation mechanism of adrenal cortisol and DHEA biosynthesis via the endogen ERAD inhibitor small VCP-interacting protein

İLHAN RECEP, ÜNER GÖKLEM, YILMAZ SİNEM, Atalay Sahar Esra, ÇAYLI SEVİL, ERZURUMLU YALÇIN, GÖZEN OĞUZ, BALLAR KIRMIZIBAYRAK PETEK Springer Science and Business Media LLC,cilt.12, ss.-, 2022 (SCI-Expanded dergi )

The role of cycloastragenol at the intersection of NRF2/ARE, telomerase, and proteasome activity

YILMAZ SİNEM, BEDİR ERDAL, BALLAR KIRMIZIBAYRAK PETEK Elsevier BV,cilt.188, ss.105-116, 2022 (SCI-Expanded dergi )

Design, synthesis and biological evaluation of novel naphthoquinone-4-aminobenzensulfonamide/carboxamide derivatives as proteasome inhibitors

UYSAL ŞİRİN,SOYER ZEYNEP,SAYLAM MERVE,TARİKOĞULLARI DOĞAN AYŞE HANDE,YILMAZ SİNEM,BALLAR KIRMIZIBAYRAK PETEK European Journal of Medicinal Chemistry,cilt.209, ss.-, 2021 (SCI dergi )

Neuroprotective activity studies of some phenylacetamide derivatives bearing 1H-pyrazole or 1H-1,2,4-triazole

SAYLAM MERVE, TARİKOĞULLARI DOĞAN AYŞE HANDE, YILMAZ SİNEM, BALLAR KIRMIZIBAYRAK PETEK Bioorganic and Medicinal Chemistry Reports,cilt., ss.-, 2021 (ProQuest, Google Scholar dergi )

A new underlying mechanism for the neuroprotective effect of bosutinib: Reverting toxicity\u2010induced PARylation in SIN1\u2010mediated neurotoxicity

YILMAZ SİNEM, BALLAR KIRMIZIBAYRAK PETEK, Alkan Tolgac Journal of Biochemical and Molecular Toxicology,cilt.35, ss.-, 2021 (SCI-Expanded dergi )

Telomerase activators from 20(27)-octanor-cycloastragenol via biotransformation by the fungal endophytes

DUMAN SEDA, EKİZ DİNÇMAN GÜNER, YILMAZ SİNEM, YUSUFOĞLU HASAN, BALLAR KIRMIZIBAYRAK PETEK, BEDİR ERDAL Bioorganic Chemistry,cilt.109, ss.-, 2021 (SCI-Expanded dergi )

Screening of cytotoxicity and DNA topoisomerase IIa inhibitory activity of Turkish Onosma species

GÜZEL ÖZGE, DUMAN SEDA, YILMAZ SİNEM, KARAKOYUN ÇİĞDEM, KUL DEMET, PİRHAN ADEMİ FAHRİ, BEDİR ERDAL TURKISH JOURNAL OF BOTANY,cilt.45, ss.-, 2021 (SCI-Expanded dergi )

Neuroprotective activity studies of some phenylacetamide derivatives bearing 1H-pyrazole or 1H-1,2,4-triazole

SAYLAM MERVE, TARİKOĞULLARI DOĞAN AYŞE HANDE, YILMAZ SİNEM, BALLAR KIRMIZIBAYRAK PETEK Bioorganic and Medicinal Chemistry Reports,cilt., ss.-, 2021 (ProQuest dergi )

Polyethers isolated from the marine actinobacterium Streptomyces cacaoi inhibit autophagy and induce apoptosis in cancer cells

Khan Nasar,YILMAZ SİNEM,Aksoy Semiha,UZEL ATAÇ,TOSUN ÇİĞDEM,BALLAR KIRMIZIBAYRAK PETEK,BEDİR ERDAL Chemico-Biological Interactions,cilt.307, ss.167-178, 2019 (SCI dergi )

Microbial Transformation of Cycloastragenol and Astragenol by Endophytic Fungi Isolated from Astragalus Species

EKİZ GÜNER,YILMAZ SİNEM,YUSUFOGLU HASAN,BALLAR KIRMIZIBAYRAK PETEK,BEDİR ERDAL Journal of Natural Products,cilt.82, ss.2979-2985, 2019 (SCI dergi )

Design, synthesis, biological evaluation and molecular docking of novel moleculesto PARP-1 enzyme

TOK FATİH,KAYMAKÇIOĞLU BEDİA,İLHAN RECEP,YILMAZ SİNEM,BALLAR KIRMIZIBAYRAK PETEK,TAŞKIN TOK TUĞBA TURKISH JOURNAL OF CHEMISTRY,cilt.43, ss.1290-1305, 2019 (SCI-Expanded dergi )

Hypericum perforatum L.: An overview of the anticancer potencies of the specimens collected from different ecological environments

GÖNENÇ TÜBA, Öztürk Munir, TÜRKSEVEN SÜLEYMAN GÜRDAL, BALLAR KIRMIZIBAYRAK PETEK, Günal Selin, YILMAZ SİNEM Pakistan Journal of Botany,cilt.52, ss.1003-1010, 2019 (SCI-Expanded dergi )

A Src/Abl kinase inhibitor, bosutinib, downregulates and inhibits PARP enzyme and sensitizes cells to the DNA damaging agents

BALLAR KIRMIZIBAYRAK PETEK,İLHAN RECEP,YILMAZ SİNEM,GUNAL SELIN,ERBAYKENT TEPEDELEN BURCU TURKISH JOURNAL OF BIOCHEMISTRY-TURK BIYOKIMYA DERGISI,cilt.43, ss.101-109, 2018 (SCI dergi )

KONFERANS & SEMPOZYUM & HAKEMLİ KONGRE & ULUSAL TOPLANTI & BİLDİRİ KİTAPLARINDA YER ALAN YAYINLAR

Utilization of Biotransformation to Obtain Novel Bioactives Towards Cellular Regeneration and Healthy Aging KÜÇÜKSOLAK MELİS, YILMAZ SİNEM, ÜNER GÖKLEM, KURU GÜLTEN, BALLAR KIRMIZIBAYRAK PETEK, BEDİR ERDAL

2. ULUSLARARASI GIDA KİMYASI KONGRESİ, ANTALYA, TÜRKİYE , ss.-, 2023.03.16

İdentification of novel cycloastragenol derivatives as potent NRF2 activators that delay replicative senesence YILMAZ SİNEM, BEDİR ERDAL, BALLAR KIRMIZIBAYRAK PETEK

3rd BenBedPhar Scientific meeting, , TÜRKİYE , ss.-, 2022.10.14

İki Ucu Keskin Bıçak: Hücrede Ölüm ve Kalımda Sapogenoller YILMAZ SİNEM, ÜNER GÖKLEM, KÜÇÜKSOLAK MELİS, BALLAR KIRMIZIBAYRAK PETEK, BEDİR ERDAL

XXIV. BİTKİSEL İLAÇ HAMMADDELERİ TOPLANTISI, Ankara, TÜRKİYE , ss.-, 2022.06.23

20(27)-Octanor-Sikloastragenol’ün Mikrobiyal Transformayonu veElde Edilen Metabolitlerin Telomeraz Aktivasyonu Üzerine Etkileri Duman Seda,EKİZ GÜNER,YILMAZ SİNEM,BALLAR KIRMIZIBAYRAK PETEK,BEDİR ERDAL

TMC 2020, , TÜRKİYE , ss.-, 2020.12.27

Telomerase activators derived from Astragalus sapogenins via biotransformation with the recently discovered endophytic fungus Camarosporium laburnicola KÜÇÜKSOLAK MELİS,EKİZ GÜNER,duman seda,YILMAZ SİNEM,BALLAR KIRMIZIBAYRAK PETEK,BEDİR ERDAL

67th International Congress and Annual Meeting of the Society for Medicinal Plant and Natural Product Research (GA), Innsbruck, AVUSTURYA , ss.1451-1451, 2019.12.13

Neuroprotective Evaluation of Some Phenylacetamide Derivatives Bearing 1,2,4-Triazole with Metal Binding Property SAYLAM MERVE, YILMAZ SİNEM, PARLAR ÇOŞKUN SÜLÜNAY, TARİKOĞULLARI DOĞAN AYŞE HANDE

MuTaLig COST ACTION CA15135 3rd Annual Meeting 2018, Valetta, MALTA , ss.79-79, 2018.10.18

Screening of Onosma Species for Cytotoxic Activity Güzel Özge,Duman Seda,YILMAZ SİNEM,PİRHAN ADEMİ FAHRİ,BEDİR ERDAL

International Conference on Natural Products for Cancer Prevention and Therapy, , , ss.-, 2017.11.17

Effect of a New Sapogenol Derivative (AG-07) onCell Death via Necrosis ERZURUMLU YALÇIN,tağ özgür,YILMAZ SİNEM,BEDİR ERDAL,BALLAR KIRMIZIBAYRAK PETEK

2nd International Conference on Natural Products for Cancer Prevention and Therapy, , , ss.996-, 2017.11.11

Yeni PARP İnhibitör Bileşiklerinin Taranması GÜNAL SELİN,İLHAN RECEP,YILMAZ SİNEM,BALLAR KIRMIZIBAYRAK PETEK,ERBAYKENT TEPEDELEN BURCU

ULUSAL TIBBİ BİYOLOJİ VE GENETİK KONGRESİ, , TÜRKİYE , ss.-, 2017.10.25

Polyethers compounds isolated from the marine actinobacterium Streptomyces cacaoi induce apoptosis and inhibit autophagy in HeLa cell line YILMAZ SİNEM,KHAN NASAR,Çetinel semiha,TOSUN ÇİĞDEM,BALLAR KIRMIZIBAYRAK PETEK,BEDİR ERDAL

2nd International Cell Death Research Congres, , , ss.-,

Bioassay Guided Isolation of Naphthoquinones from Onosma aksoyii, Investigation of Their Cytotoxic Properties KUL DEMET,KARAKOYUN ÇİĞDEM,YILMAZ SİNEM,PİRHAN ADEMİ FAHRİ,BEDİR ERDAL

67th International Congress and Annual Meeting of the Society for Medicinal Plant and Natural Product Research, , , ss.-,

DESIGN, SYNTHESIS AND BIOLOGICAL ACTIVITY STUDIES OF NOVEL NAPHTOQUINONE-AMINO ACID DERIVATIVES ASPROTEASOME INHIBITORS TATAR İREM,YILMAZ SİNEM,BALLAR KIRMIZIBAYRAK PETEK,SOYER ZEYNEP

6th EFMC Young Medicinal Chemist Symposium, , , ss.-,

The proteasome activatory property of Cycloastragenol is dependent on the Nrf-2 mediated induction of telomerase activity YILMAZ SİNEM, BEDİR ERDAL, BALLAR KIRMIZIBAYRAK PETEK

Redox Alterations and Cellular Responses: From Signalling to Interventions,FEBS Advanced course, Atina, YUNANİSTAN , ss.-,

The proteasome activator function of cycloastragenol is dependent on the NRF-2 mediated induction of telomerase activity YILMAZ SİNEM, BEDİR ERDAL, BALLAR KIRMIZIBAYRAK PETEK

First annual meeting of the ProteoCure COST Action, , SLOVENYA , ss.-,

Identification of novel Cycloastragenol derivatives as potent NRF2 activators that delay replicative senescence YILMAZ SİNEM, KÜÇÜKSOLAK MELİS, BALLAR KIRMIZIBAYRAK PETEK, BEDİR ERDAL

The 20S proteasome degradation pathway, Rehovot, İSRAİL , ss.-,

Utilization of endophytic fungi for biotransformation to obtain bioactive compounds BEDİR ERDAL, KÜÇÜKSOLAK MELİS, YILMAZ SİNEM, ÜNER GÖKLEM, BALLAR KIRMIZIBAYRAK PETEK

XVII OPTIMA Meeting, Erice-Palermo, İTALYA , ss.-,

KİTAP & KİTAP BÖLÜMLERİ

Editörlükler

Proje & Patent & Tasarım

Projeler

  • Doğal kaynaklı yeni moleküllerin potansiyel nöroprotektif etkilerinin belirlenmesi

    Nörodejeneratif hastalıklar, nöron hücrelerinin ölümünden kaynaklanan ve genellikle yaşlılıkla ilişkilendirilen bir grup hastalığı kapsamaktadır. Türkiye gibi gelişmekte olan toplumlarda nüfusun hızla yaşlanması, NDH’ların görülme sıklığını arttırmakta ve bu durum hem aileler hem de sağlık sistemi üzerinde büyük bir yük oluşturmaktadır.  Mevcut tedavilerin sadece semptomatik fayda sağlaması da NDH’ları en önemli sağlık sorunlarından biri haline getirerek etkin tedavi keşfinin önemine dikkat çekmektedir. NDH’lar patolojik mekanizmaları birbirinden oldukça farklı çeşitli nörolojik bozuklukları içerse de artmış oksidatif stres ortak etiyolojilerden biri olarak öne sürülmekte ve oksidatif dengeyi korumaya yönelik yaklaşımlar NDH’ların tedavisi için umut vaat etmektedir. Hem literatürde yapılan çalışmalar hem de proje ekibimizin önceki çalışmaları Astagalus türlerinden elde edilen bir sapogenin olan sikloastrogenol’ün (SA) hücrenin oksidatif strese karşı en önemli koruma mekanizmalarından biri olan Nrf-2 yolağının aktivasyonu ile nöroprotektif etki gösterdiğini kanıtlamıştır. Bu verilerden yola çıkarak gerçekleştirdiğimiz ön çalışmalar yine Astragalus türlerinden izole edilen siklosefagenol’ün (SF) de potent bir nöroprotektif molekül olduğunu göstermiştir. Bunun üzerine ön çalışmalarımız kapsamında mikrobiyal biyotransformasyon ile 20 adet yeni SF türevi elde edilmiştir. Proje önerimizde ise literatür için yeni olan 20 metabolitin nöroprotektif etkisinin taranması ve yapı-etki ilişkisinin ortaya konulması planlanmıştır. Ayrıca seçilecek en aktif moleküllerin reaktif oksijen türleri oluşumu, mitokondriyal hasar ve Nrf-2 aktivitesi üzerine etkileri incelenerek aktivite mekanizmaları ile ilgili bilgi edinilecektir. Literatürde SF ve türevleri ile ilgili herhangi bir biyolojik aktivitenin olmaması proje önerimiz kapsamında elde edilecek verileri oldukça özgün kılmaktadır. Ülkemizin doğal kaynaklarından elde edilmiş bir ilaç adayına odaklanmayı hedefleyen projeden olumlu sonuçlar elde edilmesi grubumuzu ileri çalışmalar için teşvik edecektir.

    Yükseköğretim Kurumları tarafından destekli bilimsel araştırma projesi
    ULUSAL , Tamamlandı
    21.12.2023 16.08.2022

  • Telomeraz aktivatör etkili sikloastragenol ve yeni türevlerinin Nrf-2 ve proteazom sistemlerine etkisi ile yaşlanma karşıtı ve nöroprotektif potansiyellerinin araştırılması

    Bu projenin temel amacı 2017/GE/398510 evrak numaralı patent başvurusunda tanımlanan bazı telomeraz aktivatörü moleküllerin yaşlanma ve nörodejeneratif hastalıkların patogenezinde önemli rolü olan Nrf-2 sinyal yolağı ve Ubikitin Proteazom Sistemi üzerindeki etkilerinin ve söz konusu yolaklar arasındaki olası etkileşimlerin araştırılmasıdır.

    -Tübitak 1001
    ULUSAL , Tamamlandı
    26.09.2023 01.10.2019

Patentler

    • Tasarımlar

    Bilimsel Çalışmalar

    BİLİMSEL ÇALIŞMALAR

    Bilimsel Üyelikler & Hakemlikler

    BİLİMSEL ÜYELİKLER

    BİLİMSEL HAKEMLİKLER

    Sanatsal Faaliyetler

    Sanatsal Faaliyetler

    Başarılar

    ÖDÜLLER

    • TMC2022 Mikrobiyoloji Konferansına ücretsiz katılım

      2020

    • SFRR-Europe/OCC travel grant

      2022

      Society for Free Radical Research Europe

    YÖKSİS ATIFLAR

    • 2021 Yılı Atıf Sayısı :0

    Duyuru & Doküman

    Duyurular

    Dokümanlar

    Diğer Faaliyetler

    DİĞER FAALİYETLER